Controlorul de zbor, creierul UAV, este responsabil de procesarea datelor de zbor și de executarea comenzilor de zbor. Controlerele de zbor-de ultimă generație dispun de obicei de mai multe moduri de zbor (cum ar fi moduri de poziționare GPS și de atitudine) și capabilități inteligente de evitare a obstacolelor, făcându-le potrivite pentru aplicații profesionale. Modulul GPS oferă informații precise de poziționare, care sunt deosebit de importante pentru scenariile care necesită o poziționare de înaltă-precizie, cum ar fi fotografia aeriană și topografia.
